Pour limiter ces risques, la pratique a pu dans certains pays être médicalisée, réalisée notamment en milieu hospitalier. Mais cette sécurisation comporte l’inconvénient, aux yeux de certains, de légitimer la pratique. 
Le contrôle des appétits sexuels de la jeune fille
L’excision est justifiée de diverses manières. Les motifs peuvent être socioculturels, visant au contrôle des appétits sexuels de la jeune fille et à garantir sa virginité lorsqu’elle est offerte en mariage. Ils peuvent être de l’ordre de la purification, de l’hygiène et de la « beauté » génitale – l’apparence « soyeuse » de la vulve cicatrisée est évoquée pour l’infibulation. Enfin les motifs peuvent être d’ordre religieux et patriarcaux. En effet l’excision faisait autrefois office de ceinture de chasteté et, aujourd’hui, confine la sexualité de la femme à la reproduction.
