Abd El Fattah est poursuivi pour avoir avoir participé à une manifestation dénonçant les procès militaires de civils en novembre 2013. Bien que plusieurs personnes ayant participé à la manifestation aient été arrêtées, elles ont ensuite toutes été libérées ou graciées, à l’exception d’Abd El Fattah.
Dans une autre affaire, Abd El Fattah est passible d’une peine de prison supplémentaire pour avoir insulté le système judiciaire égyptien pour son manque d’indépendance dans un tweet. Cette accusation découle de commentaires qu’il a fait lors d’un procès controversé en 2013 au cours duquel 43 travailleurs d’une ONG furent condamnés à une peine de prison après avoir été reconnus coupables de diffamation envers le système judiciaire égyptien.
